El 31 de marzo de 2008 se formalizó un convenio interadministrativo de colaboración para la gestión de inversiones, interventoría, mantenimiento y operación de los sistemas de acueducto, alcantarillado y aseo en la zona urbana del municipio de Quibdó, en el departamento del Chocó. El convenio es ejecutado por la filial Aguas Nacionales EPM, a través de la marca Aguas del Atrato, en un plazo de siete años, contado a partir del 1 de julio de 2008.
El 2015, fue una año muy especial para el proyecto Aguas del Atrato, pues en junio se logró la ampliación del convenio interadministrativo de colaboración entre las EPQ E.S.P. en liquidación y EPM, permitiendo que Aguas Nacionales siga en la ciudad de Quibdó, hasta diciembre del 2016.
- Servicios que presta: operación y gestión comercial de los sistemas de acueducto, alcantarillado y aseo en la zona urbana del municipio de Quibdó, lo que ha permitido la mejora de indicadores de continuidad en el servicio de acueducto y aseo.
- Población atendida: 8,489 en acueducto, 4,699 en alcantarillado y 27,389 suscriptores en el servicio de aseo.
- Cobertura geográfica: municipio de Quibdó (área urbana), departamento del Chocó.